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// Gera manifest-cell.json — as organelas do sistema "citologia".
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//
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// Chegamos a integrar uma malha 3D REAL (segmentação FIB-SEM de uma célula
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// HeLa completa, Janelia OpenOrganelle/CellMap, CC BY 4.0), mas o
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// resultado visual atrapalhava mais do que ajudava pra estudar: a
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// membrana real de uma célula aderente em cultura é achatada e irregular
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// (não a "bolinha" clássica de diagrama didático) e cobria as organelas
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// de dentro. A pedido do usuário, citologia agora é um modelo 3D
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// ILUSTRATIVO — sem malha (modelFile "n/a", mesmo padrão do tegumentar),
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// renderizado com primitivas do Three.js em
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// frontend/src/components/CellDiagram3D.tsx (mesmo princípio do boneco
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// esquemático de Planos Anatômicos, ver Mannequin.tsx).
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import { writeFileSync } from "node:fs";
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import { fileURLToPath } from "node:url";
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import path from "node:path";
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const __dirname = path.dirname(fileURLToPath(import.meta.url));
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function structure(slug, namePt, nameEn, description) {
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return {
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system: "citologia",
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slug,
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namePt,
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nameEn,
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synonyms: [],
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description,
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regionPath: ["Citologia", "Célula (modelo ilustrativo)"],
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modelFile: "n/a",
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meshName: slug,
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};
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}
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const structures = [
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structure(
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"celula-membrana-plasmatica",
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"Membrana Plasmática",
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"Plasma Membrane",
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"Envoltório que delimita a célula, controlando a entrada e saída de substâncias; formada por uma bicamada fosfolipídica com proteínas de membrana.",
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),
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structure(
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"celula-nucleo",
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"Núcleo",
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"Nucleus",
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"Organela que guarda o DNA da célula, organizado em cromatina, e comanda a síntese proteica ao transcrever RNA mensageiro; delimitado por um envoltório com poros nucleares.",
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),
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structure(
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"celula-nucleolo",
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"Nucléolo",
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"Nucleolus",
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"Região densa dentro do núcleo, sem membrana própria, onde o RNA ribossômico é transcrito e as subunidades do ribossomo começam a ser montadas.",
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),
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structure(
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"celula-reticulo-rugoso",
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"Retículo Endoplasmático Rugoso",
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"Rough Endoplasmic Reticulum",
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"Rede de membranas contínua com o envoltório nuclear, coberta de ribossomos (daí o aspecto \"rugoso\"); sintetiza e processa proteínas destinadas à secreção, à membrana ou a outras organelas.",
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),
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structure(
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"celula-reticulo-liso",
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"Retículo Endoplasmático Liso",
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"Smooth Endoplasmic Reticulum",
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"Extensão do retículo endoplasmático sem ribossomos na superfície; sintetiza lipídios e esteroides, e participa da desintoxicação de substâncias e do armazenamento de cálcio.",
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),
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structure(
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"celula-golgi",
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"Complexo de Golgi",
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"Golgi Apparatus",
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"Conjunto de sáculos membranosos empilhados, tipicamente próximo ao núcleo; processa, modifica (ex: glicosilação) e empacota proteínas vindas do retículo endoplasmático, endereçando-as ao destino final.",
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),
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structure(
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"celula-mitocondrias",
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"Mitocôndrias",
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"Mitochondria",
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"Organelas de dupla membrana responsáveis pela produção de ATP por respiração celular — a \"usina de energia\" da célula; têm DNA próprio e se multiplicam por divisão.",
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),
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structure(
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"celula-ribossomos",
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"Ribossomos",
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"Ribosomes",
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"Complexos de RNA ribossômico e proteínas que traduzem RNA mensageiro em proteínas; podem estar livres no citosol ou aderidos ao retículo endoplasmático rugoso.",
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),
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structure(
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"celula-lisossomos",
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"Lisossomos",
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"Lysosomes",
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"Vesículas com enzimas digestivas (hidrolases ácidas) que degradam material vindo de dentro ou de fora da célula — o \"sistema de reciclagem e digestão\" celular.",
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),
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];
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writeFileSync(
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path.resolve(__dirname, "manifest-cell.json"),
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JSON.stringify({ structures }, null, 2),
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);
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console.log(`manifest-cell.json gerado com ${structures.length} organelas.`);
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