fix6

data-pipeline/scripts/extract-manifest.mjs

@@ -14,6 +14,7 @@ import { fileURLToPath } from "node:url";
 import { SOURCES, SOURCE_TARGETS, RESPIRATORY_KEYWORDS } from "./sources.mjs";
 import { translateToPt } from "./translate-pt.mjs";
 import { SYSTEMS } from "../seed/systems.mjs";
+import { SKELETAL_BONES } from "./skeletal-whitelist.mjs";
 
 await MeshoptSimplifier.ready;
 
@@ -40,6 +41,48 @@ function slugify(s) {
     .replace(/^-+|-+$/g, "");
 }
 
+// O arquivo esquelético real do Z-Anatomy mistura ossos de verdade com
+// centenas de "acidentes ósseos" (pontos de referência NO osso, ex:
+// "Deltoid tuberosity" — não são ossos) e marcadores de origem/inserção
+// muscular (ex: "Pectoralis major muscle.ol" — pertencem ao músculo).
+// Por isso usamos uma lista de INCLUSÃO com os 206 ossos reais em vez de
+// aceitar tudo: só o que bate exatamente vira uma estrutura esquelética.
+const SKELETAL_ALIASES = { atlas: "Atlas (C1)", axis: "Axis (C2)" };
+const skeletalLookup = new Map(
+  Object.entries(SKELETAL_BONES).map(([key, info]) => [
+    key.toLowerCase(),
+    { canonicalKey: key, ...info },
+  ]),
+);
+
+function stripSideSuffix(rawName) {
+  const m = rawName.match(/^(.*)\.([lrij])$/i);
+  if (m) return { base: m[1].trim(), suffix: m[2].toLowerCase() };
+  return { base: rawName.trim(), suffix: null };
+}
+
+// Retorna null se o nome bruto não corresponder a nenhum dos 206 ossos —
+// nesse caso a malha é ignorada (não vira estrutura, mas continua no
+// arquivo .glb; como não há "structure" apontando pra ela, o frontend já
+// a mantém oculta automaticamente).
+function resolveSkeletalBone(rawName) {
+  const { base, suffix } = stripSideSuffix(rawName);
+  const normBase = base.toLowerCase();
+  const aliasTarget = SKELETAL_ALIASES[normBase];
+  const lookupKey = (aliasTarget ?? base).toLowerCase();
+  const entry = skeletalLookup.get(lookupKey);
+  if (!entry) return null;
+
+  if (entry.paired) {
+    // Ignora variantes ".i"/".j"/sem sufixo para ossos pareados — o
+    // Z-Anatomy parece manter cópias duplicadas (visão isolada vs.
+    // esqueleto montado); ".l"/".r" é a marcação inequívoca de lado.
+    if (suffix !== "l" && suffix !== "r") return null;
+    return { canonicalKey: entry.canonicalKey, pt: entry.pt, side: suffix };
+  }
+  return { canonicalKey: entry.canonicalKey, pt: entry.pt, side: "single" };
+}
+
 function classifySystem(key, rawName) {
   const target = SOURCE_TARGETS[key];
   if (target.system) return target.system;
@@ -81,6 +124,7 @@ for (const { fbx, key } of SOURCES) {
   }
 
   const nameCounts = new Map(); // dedupe de nomes brutos duplicados no MESMO arquivo
+  const includedBones = new Set(); // dedupe de osso+lado no sistema esquelético
   let countThisFile = 0;
 
   function visit(node) {
@@ -92,12 +136,32 @@ for (const { fbx, key } of SOURCES) {
       const uniqueMeshName = n === 1 ? rawName : `${rawName} (${n})`;
       node.setName(uniqueMeshName);
 
-      const systemSlug = classifySystem(key, rawName);
+      let systemSlug, namePt, nameEn;
+
+      if (key === "skeletal") {
+        const resolved = resolveSkeletalBone(rawName);
+        const dedupeKey = resolved ? `${resolved.canonicalKey}::${resolved.side}` : null;
+        if (!resolved || includedBones.has(dedupeKey)) {
+          for (const child of node.listChildren()) visit(child);
+          return;
+        }
+        includedBones.add(dedupeKey);
+        systemSlug = "esqueletico";
+        const sideLabel = resolved.side === "l" ? " Esquerdo" : resolved.side === "r" ? " Direito" : "";
+        const sideWord = resolved.side === "l" ? "Left " : resolved.side === "r" ? "Right " : "";
+        namePt = `${resolved.pt}${sideLabel}`;
+        nameEn = `${sideWord}${resolved.canonicalKey}`;
+      } else {
+        systemSlug = classifySystem(key, rawName);
+        namePt = translateToPt(rawName) + (n > 1 ? ` (${n})` : "");
+        nameEn = rawName + (n > 1 ? ` (${n})` : "");
+      }
+
       const material = materialFor(systemSlug);
       for (const prim of mesh.listPrimitives()) prim.setMaterial(material);
 
       const sys = systemBySlug.get(systemSlug);
-      const slugPart = slugify(uniqueMeshName) || `sem-nome-${totalStructures}`;
+      const slugPart = slugify(key === "skeletal" ? namePt : uniqueMeshName) || `sem-nome-${totalStructures}`;
       const slug = `${systemSlug}-${slugPart}`;
 
       // Gravamos o slug como "extras" do nó (→ vira object.userData no
@@ -109,8 +173,8 @@ for (const { fbx, key } of SOURCES) {
       manifest.push({
         system: systemSlug,
         slug,
-        namePt: translateToPt(rawName) + (n > 1 ? ` (${n})` : ""),
-        nameEn: rawName + (n > 1 ? ` (${n})` : ""),
+        namePt,
+        nameEn,
         synonyms: [],
         description: "",
         regionPath: [sys?.namePt ?? systemSlug],
@@ -130,6 +194,21 @@ for (const { fbx, key } of SOURCES) {
     console.warn(`  ⚠ nenhuma malha nomeada encontrada em ${fbx} — confira o log do assimp/conversão.`);
   }
 
+  if (key === "skeletal") {
+    const missing = [];
+    for (const [boneKey, info] of Object.entries(SKELETAL_BONES)) {
+      const sides = info.paired ? ["l", "r"] : ["single"];
+      for (const side of sides) {
+        if (!includedBones.has(`${boneKey}::${side}`)) missing.push(`${boneKey} (${side})`);
+      }
+    }
+    console.log(`  → ${includedBones.size}/206 ossos da lista de referência encontrados.`);
+    if (missing.length > 0) {
+      console.warn(`  ⚠ ${missing.length} ossos da lista NÃO encontrados no arquivo:`);
+      for (const m of missing) console.warn(`      - ${m}`);
+    }
+  }
+
   // Malhas do Z-Anatomy vêm pensadas para um app desktop (Unity), com
   // densidade de polígonos bem maior do que um visualizador web aguenta
   // com dezenas de estruturas na tela ao mesmo tempo. MAS: muitas das

data-pipeline/scripts/skeletal-whitelist.mjs

@@ -0,0 +1,153 @@
+// Lista de referência dos 206 ossos do corpo humano adulto, usada como
+// FILTRO DE INCLUSÃO para o sistema esquelético: o arquivo real do
+// Z-Anatomy mistura ossos de verdade com centenas de "acidentes ósseos"
+// (ex: "Deltoid tuberosity", "Greater trochanter" — pontos de referência
+// NO osso, não ossos em si) e marcadores de origem/inserção muscular
+// (ex: "Pectoralis major muscle.ol") — só o que bate exatamente com um
+// nome desta lista vira uma "estrutura" clicável no sistema esquelético;
+// o resto é ignorado (mas a malha continua no arquivo, só não aparece).
+//
+// Chave = nome bruto (em inglês) como aparece no Z-Anatomy, JÁ SEM o
+// sufixo de lateralidade/variante (.l/.r/.i/.j) — ver stripSuffix() em
+// classify-skeletal.mjs. `paired: true` = existe versão esquerda/direita.
+export const SKELETAL_BONES = {
+  // ---- Crânio: neurocrânio (8) ----
+  "Frontal bone": { pt: "Osso Frontal", paired: false },
+  "Parietal bone": { pt: "Osso Parietal", paired: true },
+  "Temporal bone": { pt: "Osso Temporal", paired: true },
+  "Occipital bone": { pt: "Osso Occipital", paired: false },
+  "Sphenoid bone": { pt: "Osso Esfenoide", paired: false },
+  "Ethmoid bone": { pt: "Osso Etmoide", paired: false },
+
+  // ---- Crânio: esqueleto facial (14) ----
+  "Nasal bone": { pt: "Osso Nasal", paired: true },
+  "Maxilla": { pt: "Maxila", paired: true },
+  "Zygomatic bone": { pt: "Osso Zigomático", paired: true },
+  "Lacrimal bone": { pt: "Osso Lacrimal", paired: true },
+  "Palatine bone": { pt: "Osso Palatino", paired: true },
+  "Inferior nasal concha bone": { pt: "Concha Nasal Inferior", paired: true },
+  "Vomer": { pt: "Vômer", paired: false },
+  "Mandible": { pt: "Mandíbula", paired: false },
+
+  // ---- Ossículos da audição (6) ----
+  "Malleus": { pt: "Martelo", paired: true },
+  "Incus": { pt: "Bigorna", paired: true },
+  "Stapes": { pt: "Estribo", paired: true },
+
+  // ---- Osso hioide (1) ----
+  "Hyoid bone": { pt: "Osso Hioide", paired: false },
+
+  // ---- Coluna vertebral (26) ----
+  "Atlas (C1)": { pt: "Atlas (C1)", paired: false },
+  "Axis (C2)": { pt: "Áxis (C2)", paired: false },
+  "Vertebra C3": { pt: "Vértebra C3", paired: false },
+  "Vertebra C4": { pt: "Vértebra C4", paired: false },
+  "Vertebra C5": { pt: "Vértebra C5", paired: false },
+  "Vertebra C6": { pt: "Vértebra C6", paired: false },
+  "Vertebra C7": { pt: "Vértebra C7", paired: false },
+  "Vertebra T1": { pt: "Vértebra T1", paired: false },
+  "Vertebra T2": { pt: "Vértebra T2", paired: false },
+  "Vertebra T3": { pt: "Vértebra T3", paired: false },
+  "Vertebra T4": { pt: "Vértebra T4", paired: false },
+  "Vertebra T5": { pt: "Vértebra T5", paired: false },
+  "Vertebra T6": { pt: "Vértebra T6", paired: false },
+  "Vertebra T7": { pt: "Vértebra T7", paired: false },
+  "Vertebra T8": { pt: "Vértebra T8", paired: false },
+  "Vertebra T9": { pt: "Vértebra T9", paired: false },
+  "Vertebra T10": { pt: "Vértebra T10", paired: false },
+  "Vertebra T11": { pt: "Vértebra T11", paired: false },
+  "Vertebra T12": { pt: "Vértebra T12", paired: false },
+  "Vertebra L1": { pt: "Vértebra L1", paired: false },
+  "Vertebra L2": { pt: "Vértebra L2", paired: false },
+  "Vertebra L3": { pt: "Vértebra L3", paired: false },
+  "Vertebra L4": { pt: "Vértebra L4", paired: false },
+  "Vertebra L5": { pt: "Vértebra L5", paired: false },
+  "Sacrum": { pt: "Sacro", paired: false },
+  "Coccyx": { pt: "Cóccix", paired: false },
+
+  // ---- Caixa torácica (25) ----
+  "Sternum": { pt: "Esterno", paired: false },
+  "First rib": { pt: "1ª Costela", paired: true },
+  "Second rib": { pt: "2ª Costela", paired: true },
+  "Third rib": { pt: "3ª Costela", paired: true },
+  "Fourth rib": { pt: "4ª Costela", paired: true },
+  "Fifth rib": { pt: "5ª Costela", paired: true },
+  "Sixth rib": { pt: "6ª Costela", paired: true },
+  "Seventh rib": { pt: "7ª Costela", paired: true },
+  "Eighth rib": { pt: "8ª Costela", paired: true },
+  "Ninth rib": { pt: "9ª Costela", paired: true },
+  "Tenth rib": { pt: "10ª Costela", paired: true },
+  "Eleventh rib": { pt: "11ª Costela", paired: true },
+  "Twelfth rib": { pt: "12ª Costela", paired: true },
+
+  // ---- Cíngulo do membro superior (4) ----
+  "Clavicle": { pt: "Clavícula", paired: true },
+  "Scapula": { pt: "Escápula", paired: true },
+
+  // ---- Membro superior livre (60) ----
+  "Humerus": { pt: "Úmero", paired: true },
+  "Radius": { pt: "Rádio", paired: true },
+  "Ulna": { pt: "Ulna", paired: true },
+  "Scaphoid bone": { pt: "Osso Escafoide", paired: true },
+  "Lunate bone": { pt: "Osso Semilunar", paired: true },
+  "Triquetrum bone": { pt: "Osso Piramidal", paired: true },
+  "Pisiform bone": { pt: "Osso Pisiforme", paired: true },
+  "Trapezium bone": { pt: "Osso Trapézio", paired: true },
+  "Trapezoid bone": { pt: "Osso Trapezoide", paired: true },
+  "Capitate bone": { pt: "Osso Capitato", paired: true },
+  "Hamate bone": { pt: "Osso Hamato", paired: true },
+  "First metacarpal bone": { pt: "1º Osso Metacarpal", paired: true },
+  "Second metacarpal bone": { pt: "2º Osso Metacarpal", paired: true },
+  "Third metacarpal bone": { pt: "3º Osso Metacarpal", paired: true },
+  "Fourth metacarpal bone": { pt: "4º Osso Metacarpal", paired: true },
+  "Fifth metacarpal bone": { pt: "5º Osso Metacarpal", paired: true },
+  "Proximal phalanx of first finger of hand": { pt: "Falange Proximal do Polegar", paired: true },
+  "Distal phalanx of first finger of hand": { pt: "Falange Distal do Polegar", paired: true },
+  "Proximal phalanx of second finger of hand": { pt: "Falange Proximal do 2º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Middle phalanx of second finger of hand": { pt: "Falange Média do 2º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Distal phalanx of second finger of hand": { pt: "Falange Distal do 2º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Proximal phalanx of third finger of hand": { pt: "Falange Proximal do 3º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Middle phalanx of third finger of hand": { pt: "Falange Média do 3º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Distal phalanx of third finger of hand": { pt: "Falange Distal do 3º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Proximal phalanx of fourth finger of hand": { pt: "Falange Proximal do 4º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Middle phalanx of fourth finger of hand": { pt: "Falange Média do 4º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Distal phalanx of fourth finger of hand": { pt: "Falange Distal do 4º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Proximal phalanx of fifth finger of hand": { pt: "Falange Proximal do 5º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Middle phalanx of fifth finger of hand": { pt: "Falange Média do 5º Dedo da Mão", paired: true },
+  "Distal phalanx of fifth finger of hand": { pt: "Falange Distal do 5º Dedo da Mão", paired: true },
+
+  // ---- Cíngulo do membro inferior (2) ----
+  "Hip bone": { pt: "Osso do Quadril", paired: true },
+
+  // ---- Membro inferior livre (60) ----
+  "Femur": { pt: "Fêmur", paired: true },
+  "Patella": { pt: "Patela", paired: true },
+  "Tibia": { pt: "Tíbia", paired: true },
+  "Fibula": { pt: "Fíbula", paired: true },
+  "Talus": { pt: "Tálus", paired: true },
+  "Calcaneus": { pt: "Calcâneo", paired: true },
+  "Navicular bone": { pt: "Osso Navicular", paired: true },
+  "Medial cuneiform bone": { pt: "Cuneiforme Medial", paired: true },
+  "Intermediate cuneiform bone": { pt: "Cuneiforme Intermédio", paired: true },
+  "Lateral cuneiform bone": { pt: "Cuneiforme Lateral", paired: true },
+  "Cuboid bone": { pt: "Osso Cuboide", paired: true },
+  "First metatarsal bone": { pt: "1º Osso Metatarsal", paired: true },
+  "Second metatarsal bone": { pt: "2º Osso Metatarsal", paired: true },
+  "Third metatarsal bone": { pt: "3º Osso Metatarsal", paired: true },
+  "Fourth metatarsal bone": { pt: "4º Osso Metatarsal", paired: true },
+  "Fifth metatarsal bone": { pt: "5º Osso Metatarsal", paired: true },
+  "Proximal phalanx of first finger of foot": { pt: "Falange Proximal do Hálux", paired: true },
+  "Distal phalanx of first finger of foot": { pt: "Falange Distal do Hálux", paired: true },
+  "Proximal phalanx of second finger of foot": { pt: "Falange Proximal do 2º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Middle phalanx of second finger of foot": { pt: "Falange Média do 2º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Distal phalanx of second finger of foot": { pt: "Falange Distal do 2º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Proximal phalanx of third finger of foot": { pt: "Falange Proximal do 3º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Middle phalanx of third finger of foot": { pt: "Falange Média do 3º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Distal phalanx of third finger of foot": { pt: "Falange Distal do 3º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Proximal phalanx of fourth finger of foot": { pt: "Falange Proximal do 4º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Middle phalanx of fourth finger of foot": { pt: "Falange Média do 4º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Distal phalanx of fourth finger of foot": { pt: "Falange Distal do 4º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Proximal phalanx of fifth finger of foot": { pt: "Falange Proximal do 5º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Middle phalanx of fifth finger of foot": { pt: "Falange Média do 5º Dedo do Pé", paired: true },
+  "Distal phalanx of fifth finger of foot": { pt: "Falange Distal do 5º Dedo do Pé", paired: true },
+};