refatoraçao citologia e histologia

data-pipeline/seed/build-manifest-cell.mjs

@@ -16,7 +16,7 @@ import path from "node:path";
 
 const __dirname = path.dirname(fileURLToPath(import.meta.url));
 
-function structure(slug, namePt, nameEn, description) {
+function structure(slug, namePt, nameEn, description, regionPath = ["Citologia", "Célula (modelo ilustrativo)"]) {
   return {
     system: "citologia",
     slug,
@@ -24,12 +24,20 @@ function structure(slug, namePt, nameEn, description) {
     nameEn,
     synonyms: [],
     description,
-    regionPath: ["Citologia", "Célula (modelo ilustrativo)"],
+    regionPath,
     modelFile: "n/a",
     meshName: slug,
   };
 }
 
+// Galeria de tipos celulares especializados — cada um ilustrativo (mesmo
+// princípio da célula genérica acima: sem malha 3D real disponível pra
+// isso), mostrando o que torna aquele tipo reconhecível/diferente de uma
+// célula genérica. Ver frontend/src/routes/CellTypesPage.tsx.
+function cellType(group, slug, namePt, nameEn, description) {
+  return structure(slug, namePt, nameEn, description, ["Citologia", "Tipos Celulares", group]);
+}
+
 const structures = [
   structure(
     "celula-membrana-plasmatica",
@@ -85,6 +93,132 @@ const structures = [
     "Lysosomes",
     "Vesículas com enzimas digestivas (hidrolases ácidas) que degradam material vindo de dentro ou de fora da célula — o \"sistema de reciclagem e digestão\" celular.",
   ),
+  structure(
+    "celula-centriolos",
+    "Centríolos",
+    "Centrioles",
+    "Par de estruturas cilíndricas (feitas de microtúbulos dispostos em 9 trincas) perto do núcleo, formando o centrossomo. Se duplicam na interfase e migram para os polos opostos antes da divisão celular, organizando as fibras do fuso mitótico/meiótico — ver o módulo de Mitose e Meiose.",
+  ),
+  structure(
+    "celula-citoesqueleto",
+    "Citoesqueleto",
+    "Cytoskeleton",
+    "Rede de filamentos proteicos (microtúbulos, filamentos de actina e filamentos intermediários) que dá forma e sustentação interna à célula, organiza o posicionamento das organelas e serve de \"trilho\" para o transporte intracelular e para o movimento da própria célula.",
+  ),
+  structure(
+    "celula-peroxissomos",
+    "Peroxissomos",
+    "Peroxisomes",
+    "Vesículas menores que os lisossomos, com enzimas oxidativas que degradam ácidos graxos de cadeia longa e neutralizam peróxido de hidrogênio (um subproduto tóxico dessas reações) usando a enzima catalase.",
+  ),
+
+  // ---- Neurônio ----
+  cellType(
+    "Neurônio",
+    "neuronio-corpo-celular",
+    "Corpo Celular (Soma)",
+    "Cell Body (Soma)",
+    "Contém o núcleo e a maior parte das organelas do neurônio (retículo endoplasmático rugoso aqui é chamado de corpúsculo de Nissl); é onde a maior parte das proteínas e neurotransmissores é sintetizada.",
+  ),
+  cellType(
+    "Neurônio",
+    "neuronio-dendritos",
+    "Dendritos",
+    "Dendrites",
+    "Prolongamentos curtos e ramificados que recebem sinais de outros neurônios (nas sinapses) e os conduzem em direção ao corpo celular.",
+  ),
+  cellType(
+    "Neurônio",
+    "neuronio-axonio",
+    "Axônio",
+    "Axon",
+    "Prolongamento único, longo (pode chegar a mais de 1 metro nos maiores neurônios do corpo), que conduz o impulso nervoso do corpo celular até o terminal sináptico.",
+  ),
+  cellType(
+    "Neurônio",
+    "neuronio-bainha-mielina",
+    "Bainha de Mielina",
+    "Myelin Sheath",
+    "Camada isolante (produzida por células de Schwann no sistema nervoso periférico, ou oligodendrócitos no central) que envolve o axônio em segmentos, aumentando MUITO a velocidade de condução do impulso. Os intervalos sem mielina entre os segmentos são os nódulos de Ranvier — é ali que o impulso \"salta\" de um nódulo a outro (condução saltatória).",
+  ),
+  cellType(
+    "Neurônio",
+    "neuronio-terminal-sinaptico",
+    "Terminal Sináptico",
+    "Synaptic Terminal",
+    "Extremidade do axônio, dilatada em botões sinápticos cheios de vesículas com neurotransmissor — é aqui que o sinal elétrico vira sinal químico, liberado na fenda sináptica para o próximo neurônio (ou célula-alvo).",
+  ),
+
+  // ---- Hemácia (eritrócito) ----
+  cellType(
+    "Hemácia (Eritrócito)",
+    "hemacia-eritrocito",
+    "Hemácia (Eritrócito)",
+    "Red Blood Cell (Erythrocyte)",
+    "Célula mais numerosa do sangue, especializada em transportar oxigênio (ligado à hemoglobina). Formato de disco bicôncavo (aumenta a área de superfície para troca de gases) e, diferente de quase toda célula humana, NÃO TEM NÚCLEO nem a maioria das organelas na fase madura — são expelidos durante a formação, abrindo mais espaço pra hemoglobina.",
+  ),
+
+  // ---- Célula Muscular Esquelética ----
+  cellType(
+    "Célula Muscular Esquelética",
+    "musculo-fibra",
+    "Fibra Muscular Esquelética",
+    "Skeletal Muscle Fiber",
+    "Célula longa e cilíndrica (uma \"fibra\"), formada pela fusão de várias células precursoras durante o desenvolvimento — por isso é MULTINUCLEADA. Contém miofibrilas (feixes de filamentos de actina e miosina) que se contraem sob comando do sistema nervoso.",
+  ),
+  cellType(
+    "Célula Muscular Esquelética",
+    "musculo-nucleos-perifericos",
+    "Núcleos Periféricos",
+    "Peripheral Nuclei",
+    "Vários núcleos (um resquício da fusão das células precursoras) posicionados na periferia da fibra, logo abaixo da membrana — diferente da maioria das células, que tem só 1 núcleo central.",
+  ),
+  cellType(
+    "Célula Muscular Esquelética",
+    "musculo-estriacoes",
+    "Estriações Transversais",
+    "Cross Striations",
+    "Padrão de faixas claras e escuras alternadas, visível ao microscópio, formado pela organização regular dos filamentos de actina e miosina em sarcômeros — é o que dá o nome \"músculo estriado\" (esquelético e cardíaco; o liso não tem essas faixas).",
+  ),
+
+  // ---- Espermatozoide ----
+  cellType(
+    "Espermatozoide",
+    "espermatozoide-cabeca",
+    "Cabeça",
+    "Head",
+    "Contém o núcleo com o DNA extremamente condensado, coberto na metade anterior pelo acrossomo — uma vesícula com enzimas que digerem a camada externa do óvulo na fecundação.",
+  ),
+  cellType(
+    "Espermatozoide",
+    "espermatozoide-peca-intermediaria",
+    "Peça Intermediária",
+    "Midpiece",
+    "Repleta de mitocôndrias organizadas em espiral ao redor do flagelo — fornecem o ATP necessário para o batimento do flagelo durante toda a jornada até o óvulo.",
+  ),
+  cellType(
+    "Espermatozoide",
+    "espermatozoide-flagelo",
+    "Flagelo (Cauda)",
+    "Flagellum (Tail)",
+    "Longo prolongamento que bate em movimento ondulatório, impulsionando o espermatozoide — a única célula humana com flagelo verdadeiro.",
+  ),
+
+  // ---- Leucócito (neutrófilo como representante) ----
+  cellType(
+    "Leucócito (Neutrófilo)",
+    "leucocito-nucleo-lobulado",
+    "Núcleo Lobulado (Polimorfonuclear)",
+    "Lobulated Nucleus (Polymorphonuclear)",
+    "Núcleo dividido em 2 a 5 lóbulos conectados por filamentos finos de cromatina — a característica que dá ao neutrófilo (e a outros granulócitos) o nome \"polimorfonuclear\".",
+  ),
+  cellType(
+    "Leucócito (Neutrófilo)",
+    "leucocito-granulos",
+    "Grânulos Citoplasmáticos",
+    "Cytoplasmic Granules",
+    "Pequenas vesículas espalhadas pelo citoplasma, cheias de enzimas antimicrobianas — são liberadas sobre bactérias fagocitadas (ou na área da infecção) como parte da resposta imune inata.",
+  ),
 ];
 
 writeFileSync(

data-pipeline/seed/build-manifest-microscopy.mjs

@@ -40,6 +40,36 @@
 //     Medula espinhal de coelho. Autor: John Alan Elson. CC BY-SA 4.0.
 //     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Rabbitspinalcord100x1.jpg
 //
+//   histologia/epitelio-simples-pavimentoso.jpg
+//     Montagem total (whole mount), padrão "pedra de calçamento" típico do
+//     epitélio pavimentoso visto de cima. Berkshire Community College
+//     Bioscience Image Library (BCCB). CC0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Epithelial_Tissues_Simple_Squamous_Epithelium_(40823230315).jpg
+//   histologia/epitelio-simples-cuboidal.jpg
+//     Túbulos renais em corte transversal, H&E. BCCB. CC0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Epithelial_Tissues_Simple_Cuboidal_Epithelium_(41681552432).jpg
+//   histologia/epitelio-pseudoestratificado.jpg
+//     Traqueia de mamífero em corte transversal, H&E, mostrando o epitélio
+//     pseudoestratificado ciliado. Autor: Magscope. CC BY-SA 4.0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Trachea_(mammal)_histology_cross-section.png
+//   histologia/tecido-conjuntivo-frouxo.jpg
+//     Montagem total (whole mount) de tecido conjuntivo frouxo/areolar,
+//     mostrando a rede de fibras colágenas onduladas. BCCB. CC0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Connective_Tissue_Loose_Aerolar_(41743649782).jpg
+//   histologia/cartilagem-elastica.jpg
+//     Corte transversal de cartilagem elástica de mamífero (coloração
+//     especial pra fibras elásticas). BCCB. CC0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Connective_Tissue_Elastic_Cartilage_(41812803082).jpg
+//   histologia/fibrocartilagem.jpg
+//     Fibrocartilagem de mamífero, tricrômico (colágeno em vermelho,
+//     matriz cartilaginosa em azul). Autora: Magda Yurchishin
+//     (fotografada numa aula de biologia do ensino médio). CC BY 4.0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microscopic_Image_of_Mammal_Fibrocartilage_Tissue.jpg
+//   histologia/esfregaco-sanguineo.jpg
+//     Esfregaço sanguíneo periférico corado (Wright), neutrófilo ao centro
+//     entre hemácias e plaquetas. Autor: Ajay Kumar Chaurasiya. CC BY-SA 4.0.
+//     https://commons.wikimedia.org/wiki/File:WBC_(neutrophil)_at_centre,_numerous_erythrocytes_and_platelets_(dot_like_bodies)_in_Wright's_stained_peripheral_blood_smear_(PBS)_microscopy.jpg
+//
 // As posições dos hotspots (x/y em % de cada imagem) ficam em
 // frontend/src/data/microscopyHotspots.ts — só apresentação, como no
 // tegumentar. Este arquivo só gera os DADOS da estrutura (nome, descrição).
@@ -178,6 +208,86 @@ add("histologia", NERV, "corpo-neuronal-histologia", "Corpo do Neurônio (Soma)"
   "Região do neurônio que contém o núcleo e a maquinaria de síntese proteica; a partir dela partem os prolongamentos (dendritos e axônio) que fazem a célula se comunicar com outras.",
   ["Tecido Nervoso"]);
 
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Epitélio simples pavimentoso
+// ---------------------------------------------------------------------
+const EP_PAV = "/histologia/epitelio-simples-pavimentoso.jpg";
+add("histologia", EP_PAV, "epitelio-simples-pavimentoso", "Epitélio Simples Pavimentoso", "Simple Squamous Epithelium",
+  "Uma única camada de células achatadas (finas, largas), com núcleo também achatado — forma ideal pra difusão rápida de gases e líquidos. Reveste alvéolos pulmonares, cápsula de Bowman no rim, e forma o mesotélio e o endotélio dos vasos sanguíneos.",
+  ["Tecido Epitelial"]);
+add("histologia", EP_PAV, "nucleo-pavimentoso", "Núcleo da Célula Pavimentosa", "Squamous Cell Nucleus",
+  "Núcleo achatado, acompanhando o formato baixo e largo da própria célula — diferente do núcleo arredondado típico de células cúbicas ou colunares.",
+  ["Tecido Epitelial"]);
+
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Epitélio simples cuboidal (túbulos renais)
+// ---------------------------------------------------------------------
+const EP_CUB = "/histologia/epitelio-simples-cuboidal.jpg";
+add("histologia", EP_CUB, "epitelio-simples-cuboidal", "Epitélio Simples Cuboidal", "Simple Cuboidal Epithelium",
+  "Uma única camada de células com altura e largura parecidas ('cúbicas'), núcleo arredondado e central. Reveste túbulos renais, folículos da tireoide e ductos de várias glândulas — funções de absorção e secreção.",
+  ["Tecido Epitelial"]);
+add("histologia", EP_CUB, "lumen-tubular-renal", "Luz do Túbulo Renal", "Renal Tubule Lumen",
+  "Espaço central e oco de cada túbulo, por onde passa o filtrado/urina em formação — delimitado ao redor por todo o anel de células cuboidais.",
+  ["Tecido Epitelial"]);
+
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Epitélio pseudoestratificado ciliado (traqueia)
+// ---------------------------------------------------------------------
+const EP_PSEUDO = "/histologia/epitelio-pseudoestratificado.jpg";
+add("histologia", EP_PSEUDO, "epitelio-pseudoestratificado", "Epitélio Pseudoestratificado Ciliado", "Pseudostratified Ciliated Epithelium",
+  "Parece ter várias camadas (\"pseudo\"-estratificado), mas é uma ÚNICA camada de células — só que de alturas diferentes, com nem todas alcançando a superfície, o que dá essa falsa impressão. As células que chegam à superfície têm cílios, que varrem o muco (com partículas presas) pra fora das vias respiratórias.",
+  ["Tecido Epitelial"]);
+add("histologia", EP_PSEUDO, "lamina-propria-traqueia", "Lâmina Própria", "Lamina Propria",
+  "Camada de tecido conjuntivo logo abaixo do epitélio, dando sustentação e contendo vasos sanguíneos, glândulas mucosas e fibras elásticas.",
+  ["Tecido Epitelial"]);
+
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Tecido conjuntivo frouxo (areolar)
+// ---------------------------------------------------------------------
+const CONJ_FROUXO = "/histologia/tecido-conjuntivo-frouxo.jpg";
+add("histologia", CONJ_FROUXO, "tecido-conjuntivo-frouxo", "Tecido Conjuntivo Frouxo (Areolar)", "Loose (Areolar) Connective Tissue",
+  "Tecido conjuntivo mais comum do corpo: poucas fibras (colágenas e elásticas), dispostas de forma solta e desorganizada numa matriz com bastante substância fundamental — preenche espaços entre órgãos e sob a pele, com boa flexibilidade e vascularização.",
+  ["Tecido Conjuntivo"]);
+add("histologia", CONJ_FROUXO, "fibroblasto-frouxo", "Fibroblasto", "Fibroblast",
+  "Célula mais numerosa do tecido conjuntivo, responsável por produzir e manter as fibras (colágeno, elastina) e a substância fundamental da matriz extracelular.",
+  ["Tecido Conjuntivo"]);
+
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Cartilagem elástica
+// ---------------------------------------------------------------------
+const CART_ELAST = "/histologia/cartilagem-elastica.jpg";
+add("histologia", CART_ELAST, "cartilagem-elastica", "Cartilagem Elástica", "Elastic Cartilage",
+  "Tipo de cartilagem com uma densa rede de fibras ELÁSTICAS na matriz (além do colágeno), o que dá flexibilidade extra, voltando à forma original depois de dobrada — encontrada na orelha externa (pavilhão auricular) e na epiglote.",
+  ["Tecido Cartilaginoso"]);
+add("histologia", CART_ELAST, "condrocito-elastica", "Condrócito", "Chondrocyte",
+  "Célula madura da cartilagem, alojada numa lacuna dentro da matriz que ela mesma produziu e mantém — ao contrário do osso, a cartilagem não tem vasos sanguíneos, então os condrócitos dependem de difusão pra se nutrir.",
+  ["Tecido Cartilaginoso"]);
+
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Fibrocartilagem
+// ---------------------------------------------------------------------
+const FIBROCART = "/histologia/fibrocartilagem.jpg";
+add("histologia", FIBROCART, "fibrocartilagem", "Fibrocartilagem", "Fibrocartilage",
+  "Tipo de cartilagem mais resistente à tração, com grossos feixes de colágeno tipo I visíveis na matriz (ao lado dos condrócitos) — diferente da hialina e da elástica, não tem pericôndrio. Encontrada nos discos intervertebrais e na sínfise púbica, onde precisa suportar bastante carga mecânica.",
+  ["Tecido Cartilaginoso"]);
+add("histologia", FIBROCART, "fibras-colagenas-fibrocartilagem", "Feixes de Colágeno", "Collagen Bundles",
+  "Feixes grossos e densos de colágeno tipo I, organizados em paralelo — dão à fibrocartilagem a resistência à tração que a hialina e a elástica não têm.",
+  ["Tecido Cartilaginoso"]);
+
+// ---------------------------------------------------------------------
+// HISTOLOGIA — Esfregaço sanguíneo periférico
+// ---------------------------------------------------------------------
+const SANGUE = "/histologia/esfregaco-sanguineo.jpg";
+add("histologia", SANGUE, "neutrofilo-esfregaco", "Neutrófilo", "Neutrophil",
+  "Leucócito mais comum do sangue, com núcleo polimorfonuclear (2 a 5 lóbulos) — primeira linha de defesa celular contra infecções bacterianas, fagocitando os micro-organismos.",
+  ["Sangue"]);
+add("histologia", SANGUE, "hemacias-esfregaco", "Hemácias", "Red Blood Cells",
+  "Células mais numerosas do esfregaço, sem núcleo, com uma área mais clara no centro (o reflexo do formato bicôncavo visto de cima) — transportam oxigênio ligado à hemoglobina.",
+  ["Sangue"]);
+add("histologia", SANGUE, "plaquetas-esfregaco", "Plaquetas", "Platelets",
+  "Fragmentos celulares pequenos (bem menores que uma hemácia), vistos como pontinhos escuros espalhados pelo esfregaço — essenciais pra coagulação sanguínea, se agregando no local de uma lesão vascular.",
+  ["Sangue"]);
+
 writeFileSync(
   path.resolve(__dirname, "manifest-microscopy.json"),
   JSON.stringify({ structures }, null, 2),